Gonorrea y clamidia en la garganta: síntomas, contagio y qué examen las detecta

La gonorrea faríngea y la clamidia en la garganta se instalan en la mucosa de la faringe después de sexo oral. No dan fiebre, casi nunca duelen y no se ven a simple vista. Quien las tiene rara vez tiene un motivo para sospecharlas, y el examen que se hizo el mes pasado tampoco las buscó.

Los casos de gonorrea en Chile se multiplicaron por 2,5 en cuatro años

El Departamento de Epidemiología del Ministerio de Salud publicó en mayo de 2026 su informe anual de gonorrea. La tasa de notificación pasó de 5,2 casos por cien mil habitantes en 2021 a 13,3 en 2025. En la Región Metropolitana el salto fue todavía mayor: de 3,6 a 11,9, con 1.010 casos notificados solo el año pasado.

El alza no se repartió pareja. En mujeres de 15 a 19 años la tasa se cuadruplicó, de 5,7 a 23,9 por cien mil. Y la brecha histórica entre hombres y mujeres, que en 2015 era de seis hombres por cada mujer, quedó en tres a uno.

Ese mismo informe registra por separado la faringitis gonocócica, que es la gonorrea instalada en la garganta: pasó de 5 casos notificados en 2021 a 28 en 2025.

Cómo llegan a la garganta

Por sexo oral. La Neisseria gonorrhoeae y la Chlamydia trachomatis no distinguen entre una mucosa y otra. El propio informe del MINSAL lo dice en su primera página: la bacteria de la gonorrea puede infectar la uretra, el cuello uterino, el recto, la conjuntiva, la faringe, la vulva y la vagina, «dependiendo de las prácticas sexuales».

La vía habitual es practicar sexo oral a una persona que tiene la infección en los genitales. También ocurre en sentido contrario, con menos frecuencia: una garganta infectada puede transmitirla a los genitales de la pareja.

El preservativo y el campo de látex reducen ese riesgo, y en sexo oral se usan bastante menos que en el resto de las prácticas. Ahí está buena parte de la explicación de por qué la garganta queda fuera del radar.

Qué síntomas dan, y por qué casi siempre no dan ninguno

La mayoría de las infecciones gonocócicas de la faringe no producen síntomas. Es lo que señala textualmente la guía de tratamiento de ITS del CDC, y con la clamidia ocurre algo parecido.

Cuando aparece algo, se parece a cualquier otra cosa:

• molestia o ardor al tragar que no termina de irse
• enrojecimiento en el fondo de la garganta
• ganglios del cuello inflamados
• a veces, puntos blancos sobre las amígdalas

Ninguno de esos signos es exclusivo de una ITS. Una faringitis viral común da lo mismo y es muchísimo más frecuente. Por eso el cuadro casi nunca se estudia como infección de transmisión sexual: se maneja como una amigdalitis, las molestias ceden en unos días y la bacteria sigue instalada.

Que los síntomas se vayan no significa que la infección se haya ido. La gonorrea faríngea no se resuelve sola: necesita antibiótico indicado por un profesional.

Sobre las fotos: no hay ninguna imagen que permita reconocerla. Buscar cómo se ve la gonorrea en la garganta no resuelve la duda, porque la mayor parte del tiempo la garganta se ve normal. Lo que separa una faringitis viral de una gonocócica no está en el aspecto, está en la muestra.

Qué otras ITS pueden estar en la garganta

Además de la gonorrea y la clamidia, hay otras que llegan por la misma vía:

• Sífilis. El chancro de la sífilis primaria puede aparecer en labios, lengua o amígdalas. Suele ser una úlcera única que no molesta y que desaparece sola aunque la infección continúe. Se estudia en sangre con el test de sífilis, no con hisopado.
• VPH. No produce faringitis. Su relación con la garganta es de largo plazo: algunos tipos de alto riesgo se asocian a cáncer orofaríngeo. Se estudia con tipificación de VPH.
• Herpes simple. Puede dar lesiones en la boca y la garganta, en general con bastante más dolor. Se estudia con serología de herpes.

El VIH no produce una infección de garganta, pero un cuadro con dolor de garganta, fiebre y ganglios en las primeras semanas después de una exposición puede corresponder al síndrome retroviral agudo. Si ese es el escenario, lo que corresponde es un test de VIH y conversar el período ventana.

Por qué un examen genital negativo no descarta la garganta

Es la duda que más nos llega por WhatsApp, y la que peor está explicada en todos lados.

La PCR no analiza tu cuerpo. Analiza la muestra que le llegó. Si la muestra fue un hisopado vaginal o uretral, el resultado dice si hay clamidia o gonorrea en esa mucosa y no dice nada sobre la faringe. Un panel negativo tomado en flujo vaginal es un panel negativo del flujo vaginal.

La guía del CDC lo convierte en una indicación concreta para el equipo de salud: a quien tiene gonorrea genital o rectal hay que preguntarle por sexo oral y, si lo hubo, tomar muestra faríngea.

Si tuviste sexo oral y quieres descartar gonorrea o clamidia en la garganta, la muestra tiene que salir de la garganta. No hay manera de deducirlo desde un examen genital ni desde uno de sangre. Si te sirve el detalle de qué mide cada técnica, está en PCR o test rápido.

Cuánto hay que esperar desde la exposición

La respuesta honesta empieza reconociendo un límite: la guía europea de clamidia de 2025 señala que falta evidencia sobre el tiempo mínimo entre la exposición y el momento en que el examen alcanza a detectarla.

Dicho eso, dos guías independientes llegan al mismo número:

• La guía europea indica tomarse el examen en la primera consulta y, si la exposición que preocupa ocurrió dentro de las últimas dos semanas, repetir la PCR a las dos semanas de esa exposición. Agrega que, por experiencia clínica, una PCR puede salir positiva ya entre el primer y el tercer día.
• La guía británica de gonorrea de 2025 usa el mismo corte: pasados 14 días desde la exposición, el resultado del examen es lo que manda; antes de esos 14 días, un negativo no alcanza para descartar y hay que evaluar el caso completo.

Para la garganta funciona igual. Si la exposición fue anoche, un PCR faríngeo hoy puede detectar la infección, pero un resultado negativo no cierra el tema y corresponde repetirlo a los catorce días. Si ya pasaron dos semanas o más, con un examen basta.

Hay una excepción que vale conocer: si tu pareja tuvo un diagnóstico confirmado, no se espera el plazo. Ahí el tratamiento se evalúa igual, aunque el examen todavía no alcance a mostrar nada.

Estos catorce días son de la clamidia y la gonorrea, y no se aplican al VIH. Ese período ventana es más largo y se mide de otra forma: está explicado en período ventana del VIH.

Cómo se toma el examen en la garganta

Es un hisopado orofaríngeo: se pasa una tórula por el fondo de la garganta y las amígdalas. No requiere ayuno ni preparación previa. Puede dar algo de arcada, y eso es todo.

La muestra se procesa por PCR, la misma técnica que se usa en la muestra genital. En MarianaCentro el examen que cubre gonorrea y clamidia es el Panel ITS 1, y se puede tomar en garganta al mismo valor que en muestra genital.

Si tuviste sexo oral y además sexo vaginal o anal sin protección, lo que corresponde es conversarlo: puede ser una muestra o pueden ser dos. Cada sitio se estudia por separado y el resultado de uno no reemplaza al del otro.

Cómo se trata

Con antibiótico. La diferencia con la infección genital es que en la garganta cuesta más erradicarla: la guía del CDC señala que las infecciones gonocócicas de la faringe son más difíciles de erradicar que las de sitios urogenitales y anorrectales, y que pocos esquemas superan el 90% de curación.

De ahí salen dos cosas prácticas. Una: el esquema no es el mismo que para una infección genital, y para la faríngea no existe una alternativa oral confiable. El antibiótico que sobró de otra vez, o el que le sirvió a alguien conocido, no corresponde acá.

Dos: las parejas sexuales de los últimos dos meses necesitan evaluación y tratamiento, aunque no tengan síntomas. Si se trata a una sola persona, la infección vuelve por donde salió. Hay más sobre eso en qué hacer si tu pareja dio positivo.

Durante los siete días posteriores al tratamiento corresponde evitar relaciones sexuales, y esperar a que las parejas también estén tratadas. En MarianaCentro la matrona revisa el resultado e indica el tratamiento en la misma consulta.

El control a los 7 a 14 días

Para una gonorrea genital o rectal, el CDC no pide repetir el examen después del tratamiento. Para la faríngea sí: indica volver entre 7 y 14 días después de la primera dosis para un test de curación.

Ninguna otra localización tiene esa indicación, y la razón es la del punto anterior: la garganta responde peor al tratamiento, y sin repetir la muestra no hay forma de saber si la bacteria se fue.

Ese control se hace repitiendo el PCR faríngeo. Lo práctico es agendarlo el mismo día en que se indica el tratamiento, porque a los catorce días las molestias ya pasaron y es fácil no volver.

Aparte de ese control, quien tuvo una gonorrea debería repetir el examen a los tres meses, en cualquier localización, por el riesgo de reinfección. La frecuencia según cada situación está en cada cuánto hacerse exámenes de ITS.

Toma el examen en garganta

El Panel ITS 1 en muestra orofaríngea cuesta $69.990 y el resultado llega en 3 a 4 días hábiles. Guardia Vieja 255, oficina 901, Providencia, a dos minutos del Metro Los Leones. Lunes a viernes de 9:00 a 19:30 y sábados de 9:00 a 16:30. No necesitas orden médica: la matrona evalúa tu caso y define qué muestra corresponde.

Preguntas frecuentes

¿Se puede tener gonorrea en la garganta sin ningún síntoma?

Sí, y es lo más habitual. La guía de tratamiento del CDC señala que la mayoría de las infecciones gonocócicas de la faringe son asintomáticas. Por eso la única forma de descartarla es tomando una muestra de la garganta, aunque no haya ninguna molestia.

¿El examen de garganta detecta clamidia y gonorrea al mismo tiempo?

Sí. El Panel ITS 1 estudia por PCR Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae y Ureaplasma urealyticum en la misma muestra. Cuesta $69.990 y el resultado llega en 3 a 4 días hábiles.

Mi PCR genital salió negativo, ¿necesito igual el de garganta?

Si tuviste sexo oral, sí. La PCR informa sobre la muestra que se analizó: un hisopado vaginal o uretral negativo no entrega información sobre la faringe. Son sitios distintos y se estudian por separado.

¿La gonorrea en la garganta se cura sola?

No. Las molestias pueden ceder en unos días, pero eso no significa que la bacteria haya desaparecido. Sin tratamiento la infección puede seguir y transmitirse a otras personas.

¿Cómo se toma la muestra de la garganta?

Con una tórula que se pasa por el fondo de la garganta y las amígdalas. No requiere ayuno ni preparación previa. Puede provocar algo de arcada y no deja molestias posteriores.

¿Cuánto cuesta el examen de gonorrea y clamidia en garganta en Santiago?

En MarianaCentro cuesta $69.990 el Panel ITS 1, el mismo valor que en muestra genital. Atendemos en Providencia y no se necesita orden médica: la matrona evalúa el caso y define qué muestra corresponde.

¿Hay que repetir el examen después del tratamiento?

En la garganta, sí. El CDC recomienda un test de curación entre 7 y 14 días después del tratamiento para la gonorrea faríngea, algo que no pide para las infecciones genitales ni rectales.

¿Se puede contagiar la gonorrea de la garganta a los genitales?

Sí. Una faringe infectada puede transmitir la bacteria a los genitales de la pareja durante el sexo oral. Por eso, cuando hay un diagnóstico, las parejas de los últimos dos meses necesitan evaluación.

¿Cuánto tengo que esperar después de la exposición para hacerme el PCR?

La guía europea de clamidia recomienda tomarse el examen en la primera consulta y repetirlo dos semanas después de la exposición cuando esta fue reciente. La guía británica de gonorrea usa el mismo corte de 14 días. Antes de ese plazo un resultado negativo no descarta la infección; pasadas las dos semanas, con un examen basta.